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黄海西部海域沉积物细菌群落及其对环境因子的响应
黄海西部海域沉积物细菌群落及其对环境因子的响应
作者:
母清林
邵君波
黄备
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
宏基因组
高通量测序
海洋沉积物
微生物群落
黄海西部
摘要:
黄海是西太平重要的边缘海.微生物群落在有机污染物生物地球化学循环中起着十分关键的作用,它们的群落结构、多样性及变化一定程度上反映了沉积物质量的变化.宏基因组学能够在整体水平解析微生物群落结构,真实地揭示原位环境中微生物群落的复杂性和多样性.2016年10月对黄海西部海域19个监测站位的微生物群落及环境因子开展了深入调查.应用Illumina MiSeq宏基因组高通量测序技术,共鉴定海域沉积物中微生物41门266属,变形菌门为明显的优势门类,其相对丰度占总数的47%.其他较为丰富的门类包括酸杆菌门(Acidobacteria),放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes),浮霉菌门(Planctomycetes)和疣微菌门(Verrucomicrobia).各站位细菌多样性非常高,但站位间差异较大.其中Chao1指数均值为7365.3;Shannon指数平均为9.65;Simpson指数平均为0.995.应用Past软件,采用CCA分析法研究细菌群落与环境因子的相关性,结果显示总磷和沉积物粒径对微生物门水平的群落分布具有显著性影响.计算细菌与环境因子间Pearson相关系数并绘制热图分析,发现酸杆菌、衣原体(Chlamydiae)和硝化螺旋菌(Nitrospirae)与总磷呈较明显的负相关.
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评价
象山港网箱养殖对近海沉积物细菌群落的影响
细菌
网箱养殖
沉积物
T-RFLP
水产养殖不同物种对水体和沉积物中细菌群落的影响
水产养殖
细菌
高通量测序技术
群落多样性
群落组成
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文献信息
篇名
黄海西部海域沉积物细菌群落及其对环境因子的响应
来源期刊
生态环境学报
学科
地球科学
关键词
宏基因组
高通量测序
海洋沉积物
微生物群落
黄海西部
年,卷(期)
2019,(7)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1423-1433
页数
11页
分类号
Q938.1|X172
字数
5764字
语种
中文
DOI
10.16258/j.cnki.1674-5906.2019.07.016
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
黄备
37
318
12.0
16.0
2
邵君波
9
174
6.0
9.0
3
母清林
17
221
8.0
14.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
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期刊影响力
生态环境学报
主办单位:
广东省生态环境与土壤研究所
广东省土壤学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-5906
CN:
44-1661/X
开本:
大16开
出版地:
广州市天河区天源路808号广东省生态环境与土壤研究所
邮发代号:
46-272
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
6290
总下载数(次)
27
总被引数(次)
152357
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