基于高通量测序的藜麦连作根际土壤微生物多样性研究

• 作者: 于宇凤 任元 侯丽媛 刘江 吴慎杰 曹秋芬 李亚莉 温鑫 王亦学 王斌 王育川 秦永军 聂园军 董艳辉
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 藜麦 连作 高通量测序 根际土壤 生物多样性
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 资源环境·植物保护
• 页码范围: 205-211
• 页数: 7页
• 分类号: S144
• 字数: 5595字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201751218

摘要

为了揭示连作藜麦土壤细菌群落结构和多样性的变化,采用高通量测序技术(Illumina-MiSeq)对不同处理(种植1 a、种植2 a)的连作藜麦根际土壤细菌进行16S rRNA基因V4区测序.结果表明,种植1 a较种植2 a的藜麦根际土壤细菌群落丰度和多样性指数都要高,其中,种植1 a较种植2 a的藜麦Chao1指数平均值增加16.4％,ACE指数平均值增加22.9％,Shannon指数平均值增加2.3％;菌群的分类学组成分析结果表明,重茬种植后,伦茨氏菌属、溶杆菌属、中慢生根瘤菌属、丛毛单菌属多样性增多;分枝杆菌属、藤黄单胞菌属、芽单胞菌属、浮霉状菌属等细菌多样性减少.功能预测分析表明,重茬种植后,编码细胞膜转运的功能基因、编码翻译、复制和修复的功能基因、编码外源性物质降解和代谢、多糖生物合成和代谢的功能基因大量减少,编码核苷酸代谢、萜类化合物的代谢、辅因子和维生素的代谢等功能基因少量减少;而编码信号转导和脂类代谢的功能基因有少量增加.