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刺参肠道及养殖环境菌群结构与功能
刺参肠道及养殖环境菌群结构与功能
作者:
丁君
丁斯予
常亚青
徐瀚晨
王姮
王荦
鲍学宇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
刺参
养殖池塘
高通量测序
菌群分析
摘要:
基于MiSeq高通量测序技术,分析了黄、渤海秋季池塘养殖刺参(Apostichopus japonicus)肠道及养殖环境菌落结构、α-多样性指数和菌群功能.结果表明:黄海和渤海养殖池塘底泥菌群Chao1指数、ACE的指数均较高,表明养殖池塘底泥菌群较为丰富;黄海和渤海养殖刺参肠道及养殖环境中优势菌门均为变形菌门(比例>43.25%);两个海域中刺参肠道中优势菌属相同,均为Halioglobus(比例>12.67%);养殖环境中的优势菌属则存在差异,黄海养殖水体的优势菌属为Roseibacillus(13.59%);渤海养殖水体优势菌属为海命菌属(Marivita)(21.33%);黄海养殖底泥样品DN-1和DN-2中优势菌属为Desulfopila(>9.26%),DN-3中优势菌属为Halioglobus(3.67%);渤海养殖底泥中优势菌属为硫深海菌属(Thioprofundum)(3.79%);在渤海海域中还发现了特有菌属海命菌属(Marivita)、Ascidiaceihabitans、别弧菌属(Aliivibrio),且所占比例较大;黄海和渤海各样品中菌群经COG及KEGG数据库分析,共注释到24组COG功能分类,主要集中在氨基酸转运与代谢;41条KEGG信号通路,主要集中在氨基酸转运与代谢、碳水化合物代谢、膜转运.研究结果为合理进行刺参养殖、疾病防控提供了理论依据.
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肠道菌群
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文献信息
篇名
刺参肠道及养殖环境菌群结构与功能
来源期刊
生态学杂志
学科
关键词
刺参
养殖池塘
高通量测序
菌群分析
年,卷(期)
2019,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
210-220
页数
11页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13292/j.1000-4890.201901.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
常亚青
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
142
766
15.0
19.0
2
王荦
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
12
39
4.0
6.0
3
徐瀚晨
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
2
5
1.0
2.0
4
丁斯予
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
1
4
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5
鲍学宇
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
1
4
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6
王姮
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
2
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传播情况
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引文网络
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养殖池塘
高通量测序
菌群分析
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
生态学杂志
主办单位:
中国生态学学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-4890
CN:
21-1148/Q
开本:
大16开
出版地:
沈阳市文化路72号
邮发代号:
8-161
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
7755
总下载数(次)
30
总被引数(次)
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