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摘要:
基于MiSeq高通量测序技术,分析了黄、渤海秋季池塘养殖刺参(Apostichopus japonicus)肠道及养殖环境菌落结构、α-多样性指数和菌群功能.结果表明:黄海和渤海养殖池塘底泥菌群Chao1指数、ACE的指数均较高,表明养殖池塘底泥菌群较为丰富;黄海和渤海养殖刺参肠道及养殖环境中优势菌门均为变形菌门(比例>43.25%);两个海域中刺参肠道中优势菌属相同,均为Halioglobus(比例>12.67%);养殖环境中的优势菌属则存在差异,黄海养殖水体的优势菌属为Roseibacillus(13.59%);渤海养殖水体优势菌属为海命菌属(Marivita)(21.33%);黄海养殖底泥样品DN-1和DN-2中优势菌属为Desulfopila(>9.26%),DN-3中优势菌属为Halioglobus(3.67%);渤海养殖底泥中优势菌属为硫深海菌属(Thioprofundum)(3.79%);在渤海海域中还发现了特有菌属海命菌属(Marivita)、Ascidiaceihabitans、别弧菌属(Aliivibrio),且所占比例较大;黄海和渤海各样品中菌群经COG及KEGG数据库分析,共注释到24组COG功能分类,主要集中在氨基酸转运与代谢;41条KEGG信号通路,主要集中在氨基酸转运与代谢、碳水化合物代谢、膜转运.研究结果为合理进行刺参养殖、疾病防控提供了理论依据.
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文献信息
篇名 刺参肠道及养殖环境菌群结构与功能
来源期刊 生态学杂志 学科
关键词 刺参 养殖池塘 高通量测序 菌群分析
年,卷(期) 2019,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 210-220
页数 11页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13292/j.1000-4890.201901.008
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 常亚青 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 142 766 15.0 19.0
2 王荦 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 12 39 4.0 6.0
3 徐瀚晨 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 2 5 1.0 2.0
4 丁斯予 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 1 4 1.0 1.0
5 鲍学宇 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 1 4 1.0 1.0
6 王姮 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 2 15 2.0 2.0
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养殖池塘
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生态学杂志
月刊
1000-4890
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大16开
沈阳市文化路72号
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1982
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