猪圆环病毒3型全基因克隆及遗传演化分析

• 作者: 孙莉 樊琼 董媛媛 金宏凯 马宇驰 马鸣潇
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 猪圆环病毒3型 全基因组 克隆 遗传演化
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 70-75
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 2874字
• 语种: 中文

摘要

辽宁地区某猪场发现疑似断奶仔猪多系统综合征(PMWS),经临床症状、病理变化和PCR检测,确诊为猪圆环病毒3型(PCV3)感染;根据GenBank中收录的PCV3基因序列,设计2对特异性引物,从患有PMWS的仔猪内脏组织中扩增PCV3全基因序列,克隆到pMD18-T载体中,经测序、拼接获得PCV3全长cDNA序列,利用DNAStar和DNAman生物软件对全基因组进行遗传变异分析.结果显示:PCV3毒株基因组全长2 000 bp,命名为CN/Liaoning-2017(简称LN株)(GenBank登录号:MH177453.1),基因组有3个开放阅读框(ORF),其中2个ORF编码的蛋白与圆环病毒的复制相关蛋白(Rep)和衣壳蛋白(Cap)同源.Cap基因大小为645 bp,编码214个氨基酸.PCV3国内株可分为3大分支(3a簇、3b簇与3c簇),LN株处于3a簇分支中,与湖北株(KY354039.1)同源性最高,达到99.7％;LN株与PCV3a簇代表株(PCV3-US-MN2016,PCV3-US-MO2015)同源性在98.8％～ 99.2％之间,与PCV3b簇代表株(PCV3-US-SD2016)的同源性为98.8％,与PCV3c簇代表株(PCV3-China-GD-2016)同源性为98.7％.Cap蛋白氨基酸位点分析显示,LN株在第68位发生突变,与其他代表株都不相同.以上试验结果表明,成功从患有PMWS的仔猪体内克隆了PCV3全基因,并完成了序列分析.LN株是辽宁省首次发现的PCV3毒株,这些数据将为研究PCV3的遗传变异和流行病学特征提供分子生物学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙莉	锦州医科大学畜牧兽医学院	32	39	3.0	5.0
2	马鸣潇	锦州医科大学畜牧兽医学院	8	4	2.0	2.0
3	金宏凯	锦州医科大学畜牧兽医学院	1	2	1.0	1.0
4	马宇驰	锦州医科大学畜牧兽医学院	1	2	1.0	1.0
5	樊琼	锦州医科大学畜牧兽医学院	1	2	1.0	1.0
6	董媛媛	锦州医科大学畜牧兽医学院	1	2	1.0	1.0