云南汉族人群CCR5基因启动子多态性与HCV慢性感染的关系

• 作者: 刘楠楠 刘舒媛 史荔 周紫云 张淑琼 朱永玉 李传印 聂磊 陈珺
• 来源期刊: 贵州医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 基因 多态性,单核苷酸 肝炎,丙型 CCR5 肝炎病毒 慢性感染 云南 汉族
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 专题研究2
• 页码范围: 18-25
• 页数: 8页
• 分类号: R575.1|R333.4
• 字数: 4446字
• 语种: 中文
• DOI: 1O.19367/j.cnki.1000-2707.2019.01.004

摘要

目的:研究云南汉族人群CCR5基因启动子单核苷酸多态性位点 (SNPs) 与丙型肝炎病毒 (HCV) 慢性感染的关系.方法:选取356例云南汉族HCV慢性感染者作为病例组, 353例健康体检者作为对照组, 采用PCR法扩增受检者CCR5基因启动子区基因序列;然后采用Sanger法对扩增序列进行测序并与Gen Bank (NC_000003.12) 序列比较获得与云南省汉族人群具有多态性的SNPs位点, 对获得的SNPs位点进行基因分型, 计算这些SNPs位点的等位基因频率和基因型频率;构建单倍型并分析遗传模式进行, 比较两组间的分布差异.结果:在CCR5基因启动子区域有9个SNPs位点, 其中rs2227010 (A＞G) 、rs2734648 (T＞G) 、rs1799987 (G＞A) 、rs1799988 (T＞C) 、rs1800023 (G＞A) 及1800024 (C＞T) 6个位点在云南省汉族人群中具有多态性;这6个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率及单倍型频率在病例组与对照组比较, 差异均无统计学意义 (P＞0.05) .结论:CCR5基因启动子中的rs2227010 (A＞G) 、rs2734648 (T＞G) 、rs1799987 (G＞A) 、rs1799988 (T＞C) 、rs1800023 (G＞A) 及1800024 (C＞T) SNPs位点与云南汉族人群HCV慢性感染无关.