鸡BCO2基因功能性单核苷酸 多态性的生物信息分析

• 作者: 张传生 张健 张贝 李祥龙 杨倩倩 耿立英 郝文文
• 来源期刊: 家禽科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 BCO2基因 非同义SNP SNP功能预测 蛋白质高级结构构建
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报道
• 页码范围: 17-21
• 页数: 5页
• 分类号: S831
• 字数: 2220字
• 语种: 中文

摘要

旨在筛选鸡BCO2基因中具有潜在生物学功能的同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs).从SNP数据库中检索出8个BCO2基因nsSNPs,利用SIFT、PolyPhen-2、PANTHER和PROVEAN方法分析引起的氨基酸替换是否可能影响BCO2的功能预测.进一步对鸡BCO2基因编码的氨基酸序列进行翻译后修饰位点预测以及进化位点保守性预测;使用SWISS-MODEL构建了BCO2野生型以及突变型蛋白质的空间结构.结果表明:3个nsSNPs(rs739117331、rs735703078和rs736211538)可能严重影响BCO2蛋白功能.