肾透明细胞癌差异基因的生物信息学分析与验证

• 作者: 周烨 崔笠 徐仁芳 施倩倩 赵友
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 肾透明细胞癌 生物信息学 差异基因 GATA3 基因表达
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1397-1403
• 页数: 7页
• 分类号: R737.11
• 字数: 3199字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-6325.2019.10.004

摘要

目的 通过生物信息学(生信学)分析筛选肾透明细胞癌的潜在靶基因,验证并探讨其意义.方法 运用生信学分析筛选基因芯片中肾透明细胞癌组织与正常肾组织间的差异基因,通过功能和通路富集分析和构建蛋白相互作用网络筛选核心基因;运用实时定量PCR、蛋白免疫印迹和免疫组织化学检测该基因在肾透明细胞癌组织和对应癌周正常肾组织中的表达水平;通过TCGA数据库分析该基因在肾透明细胞癌中的表达水平及其对生存预后的影响.结果 生信学分析筛选出差异表达的核心基因GATA3,其在肾透明细胞癌组织中表达水平显著低于相对应的癌周正常肾组织(P<0.01).TCGA数据显示GATA3在肾透明细胞癌中的表达水平显著降低(P<0.01),GATA3低表达的肾透明细胞癌患者的生存期显著降低(P<0.05).结论 生信学分析的使用能有助于筛选靶基因并分析其功能,GATA3的差异性表达可能对解释肾透明细胞癌发生、发展机制有一定帮助,并且可能被用作肾透明细胞癌的新型诊断标志物或治疗靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐仁芳	苏州大学附属第三医院泌尿外科	41	96	5.0	8.0
2	施倩倩	苏州大学附属第三医院泌尿外科	10	22	2.0	4.0
3	崔笠	苏州大学附属第三医院泌尿外科	11	23	2.0	4.0
4	赵友	苏州大学附属第三医院泌尿外科	4	3	1.0	1.0
5	周烨	苏州大学附属第三医院泌尿外科	5	3	1.0	1.0