结直肠癌组织中差异表达cirRNA的筛选及功能分析

• 作者: 张晶 徐忠法 李建祺 欧阳雅博 甄亚男 肖瑞雪 魏飞力
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠癌 环状RNA hsa_circ_0079656 HINFP基因 细胞周期
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 13-16
• 页数: 4页
• 分类号: R735.3
• 字数: 3462字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2019.08.004

摘要

目的 筛选结直肠癌组织中差异表达的环状RNA(circRNA),并分析其在结直肠癌发生发展中的作用.方法 收集9例原发性结直肠癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织标本,根据TNM分期分为A(T1～3 N0 M0)、B(T4a～b N0M0)、C(T4a～bN1～2M0)组.用Affymetrix Clariom D芯片检测、筛选各组差异表达的circRNA并进行聚类分析和表达趋势分析,通过构建共表达调控网络筛选重点差异表达circRNA及其对应的mRNA.利用GO数据库和KEGG数据库分别进行基因功能注释分析和信号通路富集分析,最终筛选功能最显著的基因及其对应circRNA.结果 A组癌组织与癌旁组织比较,circRNA表达降低者有165个、升高239个;B组分别为284个、276个;C组分别为190个、220个.随着结直肠癌病情进展,差异表达circRNA的表达水平呈逐渐下降趋势.选择既符合主流表达变化趋势同时更具有统计学意义的circRNA群与共表达调控网络基因属性评分前10位的circRNA进行交集处理,筛选出8个与结直肠癌进展密切相关的circRNA即hsa_circ_0000007、hsa_circ_0001111、hsa_circ_0006977、hsa_circ_0079656、hsa_circ_0023608、hsa_circ_0024508、hsa_circ_0026694、hsa_circ_0029903.预测8个circRNA相应的mR-NA,GO分析及KEGG分析结果显示,被富集的大部分基因及hsa03010通路主要参与核糖体RNA的加工与代谢、RNA的剪切与加工处理等细胞基础功能,其中hsa_circ_0079656相关的HINFP基因主要参与细胞周期中G1/S期转录过程调控.结论 hsa_circ_0079656在结直肠癌组织中低表达,且随结直肠癌进展表达逐步降低;其可能通过作用于HINFP基因调控细胞周期中G1/S期的转录过程,进而影响结直肠癌的进展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏飞力	首都医科大学附属北京佑安医院北京市肝病研究所	20	67	4.0	6.0
2	徐忠法	山东省医学科学院附属医院	42	213	8.0	12.0
3	张晶	山东省医学科学院附属医院	12	65	5.0	8.0
4	肖瑞雪	山东省医学科学院附属医院	9	47	3.0	6.0
5	甄亚男	山东省医学科学院附属医院	13	70	5.0	8.0
6	欧阳雅博	首都医科大学附属北京佑安医院北京市肝病研究所	9	18	3.0	3.0
7	李建祺	济南大学山东省医学科学院医学与生命科学学院	1	1	1.0	1.0