京海黄鸡柔嫩艾美耳球虫感染后盲肠转录组分析

• 作者: 于海亮 张涛 张跟喜 戴国俊 施会强 林雨鑫 王晓慧 王金玉 谢恺舟 邹文斌
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 京海黄鸡 柔嫩艾美尔球虫 盲肠 转录组测序 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 64-71
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0257

摘要

为了探究京海黄鸡感染柔嫩艾美尔球虫(E.tenella)后盲肠组织差异表达基因,以及球虫感染分子应答过程和免疫应答机制,试验采用RNA-seq技术对E.tenella感染和非感染组第7天的盲肠组织进行转录组测序,筛选差异表达基因,并进行差异基因的功能、通路富集分析.结果表明,在感染和非感染组中有显著差异的表达基因2830个(P<0.05),其中1419个基因上调,1411个基因下调.随机选取10个差异基因进行qRT-PCR验证,结果显示差异基因的表达倍数与RNA-seq检测结果显著相关(r=0.988,P<0.000),决定系数达0.975.GO分析表明,有2356个差异基因获得GO功能注释,显著富集的前30个GO terms主要涉及细胞交流、信号转导、血管生成、氧化还原酶活性等.KEGG分析发现差异基因显著富集的信号通路有黏着斑、细胞外基质-受体相互作用、过氧化物酶体增殖物激活受体等.这些通路中的差异基因有ANGPTL4、ACSL5、VEGFC、CD44和MAKP10等,提示这些基因在宿主柔嫩艾美耳球虫感染过程中发挥重要作用.