胃癌患者伊立替康耐药前后基因表达谱的差异

• 作者: 孙大勇 李冬兵 赵素芳
• 来源期刊: 广东医学
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 转录组测序 耐药 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2019,（17）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 2465-2473
• 页数: 9页
• 分类号: R735.2|R696.3
• 字数: 4608字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13820/j.cnki.gdyx.20191329

摘要

目的 旨在通过转录组测序,明确胃癌患者产生伊立替康耐药前后的基因表达谱差异.方法 取胃癌患者用药前后的穿刺组织,进行RNA-seq,测序的覆盖度100×;对测序得到的原始数据通过生物信息学软件进行一些分析.结果 生物信息学分析发现,胃癌患者耐药前后的组织转录水平分别有22003和21127个表达基因,其中有541个差异基因达到显著性水平;GO和KEGG分析发现这些差异基因主要富集在26条生物通路;这些通路与PI3K-Akt信号通路、胃酸分泌、黏附连接、蛋白质的消化和吸收、细胞周期和胆汁分泌相关;最终筛选得到的与胃癌产生伊立替康耐药密切相关的基因包括ABCA3、ADAMTS15、ALMS1、BCL2L11、C1QTNF6、CAPN9、COL12A1、COL5A3、COL7A1、IRF4、KRAS、MPP6、PCDHA1、PIK3CA、POU2AF1和USP13等.结论 本研究提供了胃癌患者耐药前后的转录本信息,获得了与胃癌患者产生伊立替康耐药密切相关的潜在候选基因,为胃癌的个性化精准治疗提供一定的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙大勇	深圳市第二人民医院消化科	7	0	0.0	0.0
2	赵素芳	深圳市第二人民医院消化科	13	49	4.0	7.0
3	李冬兵		1	0	0.0	0.0