湖羊卵巢不同发育阶段的miRNA鉴定与分析

• 作者: 张秀秀 李嫒 苗向阳 解领丽 黄万龙
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: miRNA 卵巢 发育 功能注释 绵羊
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术与繁殖
• 页码范围: 1396-1404
• 页数: 9页
• 分类号: S826.3
• 字数: 5122字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.07.008

摘要

旨在分析不同发育阶段绵羊卵巢组织中miRNA的表达水平,了解miRNA表达及其调控机理.本研究采用转录组测序技术鉴定1和8月龄湖羊卵巢组织中的miRNA,运用生物信息学方法对差异表达的miRNA进行靶基因预测,并对靶基因进行GO和KEGG功能注释,筛选参与卵巢发育的miRNAs.结果 显示,6个样品中检测到的已知miRNA个数分别为2 186、2 091、2 217、2 136、2 176、2 088,新miRNA的个数分别为613、567、668、640、662、450.筛选到701个差异表达novel miRNAs,38个差异表达已知miRNAs.对差异表达miRNAs的靶基因进行GO和KEGG分析,发现主要富集在血管内皮生长因子通路和卵巢类固醇生成等过程.对3个差异miRNAs进行qRT-PCR验证,与测序结果一致.oar-let-7b、oar-miR-29a、oar-miR-134-3p、oar-miR-541-3p等的靶基因富集在TGF-beta通路、卵巢卵泡生长等与卵巢发育相关的生物过程.oar-miR-148a、oar-miR-136的靶基因调控颗粒细胞增殖和类固醇生成,可能参与调控绵羊卵巢发育.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苗向阳	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室	71	407	11.0	16.0
2	张秀秀	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室	7	33	3.0	5.0
3	黄万龙	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室	6	30	3.0	5.0
4	李嫒	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室	4	26	3.0	4.0
5	解领丽	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室	2	5	1.0	2.0