宏基因组学揭示二氟沙星对牦牛瘤胃微生态及CAZy谱影响

• 作者: 何世明 安雅静 文勇立 李子谦 李强 艾鷖 赵佳琦 齐沛森
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 瘤胃微生物 抗生素 宏基因组 二氟沙星 牦牛
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 基础兽医
• 页码范围: 62-69
• 页数: 8页
• 分类号: S859.79+6
• 字数: 5268字
• 语种: 中文

摘要

反刍动物瘤胃微生物结构和功能关系到生态系统正常的物质循环、能量流动.为了探讨抗生素对瘤胃微生态的影响,揭示抗生素对反刍动物瘤胃微生物影响的规律,以牦牛为研究对象,进行二氟沙星(DIF)处理,采集瘤胃液,提取DNA,采用宏基因组学方法分析DIF对瘤胃微生物组成及碳水化合物酶类(CAZy)的影响.结果 显示,拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)等相对丰度下降,而厚壁菌门(Firmicutes)、广古菌门(Euryarchaeota)等增加.普雷沃菌属(Prevotella)、拟杆菌属(Bacteroides)等相对丰度下降,而金黄杆菌属(Chryseobacterium)、链球菌属(Streptococcus)等增加;CAZy酶类中,CBM17、CBM25等丰度上调(P＜0.01或P＜0.05);GH53、CE8、CE13、CBM21、CBM26及对接蛋白(dockerin)等下调(P＜0.01或P＜0.05).结论:DIF影响瘤胃微生物结构,并不同程度改变各优势门、属的相对丰度,抑制部分有益菌的作用;改变CAZy酶中部分家族基因丰度,影响瘤胃微生物对淀粉及果胶的降解作用,降低瘤胃微生物降解植物纤维素的效率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	文勇立	西南民族大学青藏高原研究院	77	511	12.0	18.0
2	李强		46	119	7.0	8.0
3	艾鷖	西南民族大学青藏高原研究院	16	43	3.0	6.0
4	赵佳琦	西南民族大学青藏高原研究院	4	3	1.0	1.0
5	安雅静	西南民族大学青藏高原研究院	3	2	1.0	1.0
6	李子谦	西南民族大学青藏高原研究院	3	2	1.0	1.0
7	齐沛森	西南民族大学青藏高原研究院	3	2	1.0	1.0