RNA-Seq定量分析盐肤木对铅胁迫的响应

• 作者: 周垂帆 夏丽丹 张虹 曹升 胡华英
• 来源期刊: 农业环境科学学报
• 关键词: 盐肤木 铅胁迫 核糖体 RNA-Seq
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 污染生态
• 页码范围: 1459-1467
• 页数: 9页
• 分类号: X171.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.11654/jaes.2018-1571

摘要

为探究重金属污染地生态修复先锋植物——盐肤木对重金属胁迫的分子响应机制,设置3个铅胁迫水平(0、250、1000 mg·kg-1),应用Illumina HiSeqTM 2000进行盐肤木根系的转录组测序,并通过Gene Ontology(GO)与Pathway功能显著富集分析方法,分析说明盐肤木响应不同铅胁迫水平下的差异表达基因.结果表明,盐肤木在遭受轻度铅胁迫时,主要有4类水解酶与2类磷酸酶相关基因显著富集,说明盐肤木主要通过调节细胞内水解酶与磷酸酶相关基因来抵御胁迫,而在重度铅胁迫下,主要有6类氧化还原酶相关基因出现显著富集,此时氧化还原酶相关基因起到主要调节作用;盐肤木在铅胁迫下细胞受损,在轻、重度铅胁迫下,分别有24、16类细胞相关基因显著富集,但其自身可通过调节细胞内细胞器、细胞质等相关的细胞运动以应对逆境;核糖体代谢通路是盐肤木适应铅胁迫的主要代谢通路.研究表明,核糖体相关基因是盐肤木响应铅胁迫的主要应答与调节基因.