与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络构建

• 作者: 何玉琪 张露 徐晓文 惠李 杨旭娜 潘名志 谷晓楚
• 来源期刊: 中国医药科学
• 学科: 医学
• 关键词: 多形性胶质母细胞瘤 生存期 权重基因 共表达网络 相关性研究
• 年，卷（期）: 2019,（24）
• 所属期刊栏目: 工作探讨
• 页码范围: 287-289,293
• 页数: 4页
• 分类号: R739.41
• 字数: 2409字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0616.2019.24.079

摘要

目的 构建与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络. 方法 采用R软件平台下的权重基因共表达网络构建多形性胶质母细胞瘤组织表达谱共表达网络,与患者生存期进行相关性分析,并对与生存期显著相关的共表达网络中的基因集进行通路富集. 结果 权重基因共表达网络共构建了31个共表达模块,其中有一个包含199个基因的模块与患者生存期显著相关(r=0.35,P＜0.01).通路分析发现,这199个基因显著富集于整合素、胶原蛋白、硫酸软骨素等细胞外基质相关通路以及Wnt、表皮生长因子受体(EGFR)、血管内皮生长因子(VEGF)、尿激酶型纤溶酶原激活因子(uPA)和伊立替康等代谢相关通路中. 结论 成功构建了与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络,应用该网络分析发现了与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的信号通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张露	江苏省苏州市广济医院临床检验科	6	9	2.0	3.0
2	徐晓文	江苏省苏州市广济医院临床检验科	2	1	1.0	1.0
3	何玉琪	江苏省苏州市广济医院临床检验科	3	10	2.0	3.0
4	潘名志	江苏省苏州市广济医院临床检验科	3	3	1.0	1.0
5	杨旭娜	江苏省苏州市广济医院医务部	1	0	0.0	0.0
6	惠李	江苏省苏州市广济医院科教部	2	6	1.0	2.0
7	谷晓楚	江苏省苏州市广济医院临床检验科	1	0	0.0	0.0