180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡基因结构及SNP分析

• 作者: 刘志勇 张细权 林哲敏 赵建国 邢增杨 邱峰芳 顾丽红
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 文昌鸡 RNA测序 可变剪接 单核苷酸多态性 新转录本
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 7-15
• 页数: 9页
• 分类号: S831.2
• 字数: 5886字
• 语种: 中文

摘要

采用生物信息学的方法对180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡RNA-Seq的94 614 632的Clean Reads进行了单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪接筛查、基因结构优化和新转录本预测.结果 共得到可靠的SNP位点220 308个,可变剪接56119个,优化了21 633个基因,预测到1235个新转录本.本研究结果能够进一步完善鸡基因组注释情况并丰富鸡SNP数据库和可变剪切数据库.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张细权		109	1363	19.0	31.0
2	赵建国	海南大学热带农林学院	35	83	4.0	7.0
3	林哲敏	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	57	89	4.0	6.0
4	邱峰芳		9	129	5.0	9.0
5	顾丽红	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	24	43	3.0	5.0
6	刘志勇	海南大学热带农林学院	4	8	2.0	2.0