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马铃薯St4CL的克隆及表达分析
马铃薯St4CL的克隆及表达分析
作者:
叶广继
周云
杨永智
王舰
范希德
谢海娟
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
马铃薯
4-香豆素辅酶A连接酶
表达分析
晚疫病
摘要:
4-香豆素辅酶A连接酶(4CL)是苯丙烷代谢途径中关键酶之一,克隆马铃薯4CL,并分析其表达情况,为马铃薯4CL的功能研究奠定基础.从马铃薯青薯9号中克隆St4CL,并进行生物信息学分析,采用qRT-PCR技术检测St4CL在青薯9号各组织中以及不同马铃薯品种中的表达量.结果表明,St4CL的CDS长度为1710 bp,编码569个氨基酸,蛋白分子质量约为61.83 kD,等电点为5.53.生物信息学分析表明,St4CL蛋白是稳定的疏水性蛋白,具有无规则卷曲(42.36%)、α-螺旋(28.47%)、延伸连(21%)、β-折叠(8.08%);亚细胞定位预测显示,St4CL位于叶绿体类囊体膜上;系统进化分析表明,St4CL蛋白与番茄的Sl4CL蛋白亲缘关系最近,二者同源性为97%.St4CL启动子区域含有多种与逆境响应相关的顺式作用元件,如脱落酸响应元件、赤霉素响应元件以及与干旱和黄酮类生物合成相关的MYB结合位点.qRT-PCR结果显示,St4CL在青薯9号各组织中均有表达,叶片中表达量最高,花中次之,根中表达量最低;在不同马铃薯品种中的表达量存在差异,在高抗晚疫病品种青薯10号中表达量最高,感病品种下寨65中的表达量最低.
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胁迫
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马铃薯St4CL的克隆及表达分析
来源期刊
生物技术通报
学科
关键词
马铃薯
4-香豆素辅酶A连接酶
表达分析
晚疫病
年,卷(期)
2019,(11)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1-8
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0505
五维指标
传播情况
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引文网络
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4-香豆素辅酶A连接酶
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研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
生物技术通报
主办单位:
中国农业科学院农业信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-5464
CN:
11-2396/Q
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区中关村南大街12号
邮发代号:
18-92
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7180
总下载数(次)
42
总被引数(次)
53964
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