马丙酮酸脱氢酶激酶4基因序列生物信息学分析

• 作者: 刘娟 刘永斌 孙玉江 董彦飞 陈建兴 马芷妍
• 来源期刊: 畜牧与饲料科学
• 学科: 农学
• 关键词: 肌酸激酶 生物信息学分析 二级结构 同义氨基酸密码子相对使用度
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S821.2|S818.9
• 字数: 3760字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12160/j.issn.1672-5190.2019.11.001

摘要

通过采用生物信息学软件对马丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因序列进行生物信息学的初步研究分析,从而发现该酶基因序列编码特征及其二级结构规律.结果表明:马PDK4的CDS区AUU、AUG和GAU密码子出现的次数最多(14次),分别占总413个密码子的34‰.未参与编码的密码子UGC的RSCU值最小(为0),ACA密码子的RSCU为最大值2.22,CAU、CAC、CGA、AAA、AAG 5个密码子的RSCU值为1(即未发现密码子使用偏好).马PDK4的CDS区共翻译出412个氨基酸,这些氨基酸以亮氨酸的比例最高,色氨酸的比例最低.PDK4的蛋白质二级结构以无规则卷曲为主,β 折叠和 α 螺旋为辅,构成其复杂的空间结构.马PDK4多肽链中亲水性氨基酸分布多于疏水性氨基酸,PDK4蛋白质整体疏水性较差.预测马PDK4多肽链的等电点为6.64.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈建兴	赤峰学院化学与生命科学学院	27	40	4.0	4.0
2	刘永斌		20	550	2.0	20.0
3	刘娟	赤峰学院化学与生命科学学院	2	0	0.0	0.0
4	董彦飞	赤峰学院化学与生命科学学院	4	0	0.0	0.0
5	孙玉江	青岛农业大学动物科技学院	12	23	3.0	4.0
9	马芷妍	赤峰学院化学与生命科学学院	2	0	0.0	0.0