夏枯草的转录组测序与次生代谢产物生物合成相关基因的挖掘

• 作者: 张梦佳 朱畇昊 李璐 董诚明 赵乐
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 夏枯草 转录组 次生代谢 生物合成 测序
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1220-1226
• 页数: 7页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2019.05.028

摘要

目的 获得夏枯草转录组信息,探索夏枯草次生代谢产物生物合成的分子基础.方法 利用Iilumina HiSeq 2000高通量测序技术对夏枯草果穗、茎和叶等部位进行转录组测序,经Trinity软件组装后获得Unigene,并进行系统的生物信息学分析.结果 共获得77 863条Unigene,平均长度为716.72 nt.通过与NR、Swiss-Prot、COG等7个公共数据库进行BLAST比对,共有41 367个Unigene获得注释,注释率为53.13％.在KEGG数据库中,有1 406条Unigene被注释到次生代谢产物合成.通过对转录组数据深入挖掘发现,参与夏枯草三萜类骨架合成的Unigene共有60个,参与酚酸类合成的Unigene 共有24个,参与次生代谢后修饰的Unigene共有259个,参与其他次生代谢合成的Unigene共有118个.结论 夏枯草转录组数据为探索夏枯草次生代谢产物的生物合成机制提供了重要的资源,也为利用代谢工程增加夏枯草中重要次生代谢产物含量提供了基础信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董诚明	河南中医药大学药学院	140	944	15.0	24.0
3	赵乐	河南中医药大学药学院	45	96	6.0	8.0
7	朱畇昊	河南中医药大学药学院	21	44	4.0	5.0
9	张梦佳	河南中医药大学药学院	6	7	1.0	2.0
10	李璐	河南中医药大学药学院	25	72	5.0	7.0