一株巨菌草内生生防菌的分离、鉴定及其基因组测序分析

• 作者: 宋昭昭 林占熺 林标声 梅兰 贾雨雷 黄在兴
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 巨菌草 内生链霉菌 玉蜀黍平脐蠕孢 拮抗 基因组测序分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 前植物生产层
• 页码范围: 632-639
• 页数: 8页
• 分类号: Q93-331
• 字数: 6469字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2018-0375

摘要

以巨菌草(Pennisetum giganteum sp.)内生细菌为试验材料,利用平板对峙法筛出对玉蜀黍平脐孺孢(Bipolris maydis)具有较强拮抗作用的巨菌草内生菌,并采用Illumina Miseq PE150对该菌株进行基因组测序、基因组分析、基因预测与功能注释、直系同源簇[COG]聚类分析等.结果 表明,抗菌作用最强的内生菌JK7-2为链霉菌(Streptomyces sp.),通过基因组测序分析,获得290 Conrigs,整个基因组大小约8.4 Mb,GC含量为73.17％,序列已提交至NCBI数据库SRA BioProject获得登录号:PRJNA451251.同时,预测其编码7 432个基因,并发现多个与链霉素、青霉素和四环素产生等代谢通路相关的基因.研究结果为深入研究巨菌草内生生防菌的抗菌机制以及挖掘生防菌次级代谢产物相关基因提供了理论依据.