基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析

• 作者: 吴建利 江绍玫 江绍琳 王惠梅 苏晓娜 谢小燕
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 野生菰 ISSR分子标记 遗传多样性 琼脂糖凝胶电泳 聚丙烯酰胺凝胶电泳 华东地区
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 2638-2646
• 页数: 9页
• 分类号: S519|Q943
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.12.03

摘要

[目的]筛选更优的ISSR-PCR扩增产物电泳检测方法,分析我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性,为建立和完善菰植物种质库及合理开发与利用菰资源提供理论依据.[方法]挑选7条ISSR引物对华东地区9个野生菰居群104份材料基因组DNA进行PCR扩增,其ISSR-PCR产物分别采用2％琼脂糖凝胶电泳和5％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测.[结果]2％琼脂糖凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的多态性位点百分率(PPB)为63.49％、观测等位基因数(Na)为1.6349、有效等位基因数(Ne)为1.3012、Nei's基因多样性指数(He)为0.1871、Shannon's信息指数(I)为0.2908、居群间遗传分化系数(Gst)为0.3922、遗传相似系数(Gs)变化范围在0.8293～0.9775;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.885时,9个野生菰居群被分为两大类,SH(上海)和PYH(鄱阳湖)居群归为一类,其他7个居群归为另一类.5％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的PPB为78.03％、Na为1.7803、Ne为1.2762、He为0.1804、I为0.2914、Gst为0.5086、Gs变化范围在0.7679～0.9837;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.850时,9个居群也被分为两大类,其中PYH居群单独为一类,其他8个居群归为另一类.[结论]我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性丰富,居群间和居群内变异显著,基于ISSR分子标记的野生菰遗传多样性采用5％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测可获得更可靠的遗传图谱,而2％琼脂糖凝胶电泳检测更适合早期的ISSR分子标记引物筛选.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江绍琳	江西农业大学农学院	21	159	7.0	12.0
2	吴建利		17	601	11.0	17.0
3	谢小燕	江西财经大学艺术学院	5	5	1.0	2.0
4	王惠梅		6	49	3.0	6.0
5	江绍玫	江西财经大学统计学院	7	63	4.0	7.0
6	苏晓娜	江西农业大学南昌商学院	5	2	1.0	1.0