三斑海马及其混伪品的DNA条形码分子鉴定研究

• 作者: 张光霁 朱玲燕 程汝滨 葛宇清 陈梦 黄真
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 三斑海马 COI 16 S rRNA ATP6 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2019,（22）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 5554-5562
• 页数: 9页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2019.22.025

摘要

目的 建立三斑海马Hippocampus trimaculatus的COI、16 S rRNA和 ATP6的条形码序列数据库,应用DNA条形码技术从分子水平快速准确鉴定三斑海马和其他正伪品海马,探讨海马属药材鉴定的新方法.方法 提取三斑海马药材的基因组DNA,PCR扩增 COI、16 S rRNA和 ATP6的序列并进行双向测序,所得序列采用软件 Codon Code Aligner V4.2对测序峰图进行校对拼接,应用 Clustal X 软件进行序列比对,MAGA 5.0软件计算三斑海马的种内种间遗传距离(Kimura 2-Parameter,K2P,构建邻接树(Neighbor-joing tree,NJ Tree)聚类分析不同品种海马药材的鉴定结果.结果 获得的三斑海马线粒体 COI、16 S rRNA、ATP6序列长度分别649、572、603～605bp,其中3个条形码序列的种内变异位点碱基数分别为 8、4和15,种内的变异率较小,COI、16 S rRNA、ATP6序列的平均种内K2P遗传距离 0.002、0.001和0.006,均远小于三斑海马的种间K2P距离;NJ树结果显示三斑海马与其他海马均可明显区分,具有良好的单系性.结论 COI、16S rRNA、ATP6序列作为条形码均可以鉴定三斑海马及其他混伪品海马药材,为动物类药材及其棍伪品和近源物种的分子鉴定提供依据,为对保障海马临床用药安全提供了新的技术手段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄真	浙江中医药大学药学院	98	923	18.0	28.0
2	张光霁	浙江中医药大学药学院	132	508	12.0	19.0
3	程汝滨	浙江中医药大学药学院	49	143	7.0	10.0
4	葛宇清	浙江中医药大学第一临床医学院	19	56	3.0	7.0
5	陈梦	浙江中医药大学药学院	4	23	3.0	4.0
6	朱玲燕	浙江中医药大学药学院	4	4	1.0	2.0