基于转录组测序的青风藤内青藤碱合成途径分析

• 作者: 乔克威 周喜新 曾茜垚 李雨嫣 杨华 熊兴耀
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 青风藤 青藤碱 高效液相色谱法 转录组测序 Qrt-PCR
• 年，卷（期）: 2019,（22）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 5537-5544
• 页数: 8页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2019.22.023

摘要

目的 探究控制青藤碱含量的表达基因、青藤碱合成途径中的控制位点以及表达路径.方法 利用HPLC法对6个种群共49株青风藤的根和茎分别进行了青藤碱含量的测定,选定青藤碱含量差异倍数大的 2个种群,即陕西宝鸡与贵州遵义,分别选取其中最具代表性的青风藤植株,并取其根和茎进行转录组测序,命名为HR/LR、HSILS.结果 将 clean reads进行拼接得到 355 201个转录本,其中包括275 491个 Unigene.在HR/LR和HS/LS中差异基因分别有23 562和 37 143个.GO分析显示这些差异基因功能明显富集在天冬氨酸型肽链内切酶活性与天冬氨酸肽酶活性上,推测这些差异基因可能编码这2种酶.KEGG富集结果表明HR与LR以及HS与LS2组中的差异基因共同参与糖类代谢、蛋白质与细胞膜结合、维生素C合成.qRT-PCR验证了异喹啉生物碱合成途径上游关键基因表达情况,发现与青藤碱的积累呈正相关.结论 本研究初步了解了造成青藤碱含量差异的分子机制,为深入了解青藤碱积累规律与合成途径提供了参考.