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基于16S rDNA测序对茶园土壤细菌群落多样性的研究
基于16S rDNA测序对茶园土壤细菌群落多样性的研究
作者:
吕才有
李永梅
杨广容
蒋宾
谢瑾
马会杰
马燕
原文服务方:
生态学报
茶园土壤
细菌
宏基因组
高通量测序
多样性
摘要:
土壤细菌群落组成和多样性,对茶园土壤生态系统健康和肥力可持续性具有的重要理论意义.利用Illumina高通量测序技术测定分析16S rDNA,研究云南景迈山、布朗山和南糯山的现代茶园、古茶园(林)和森林土壤的细菌群落结构与多样性.结果 表明:古茶园土壤细菌的丰度和多样性高于现代茶园及森林;研究土壤样本细菌共分属47个菌门、89个目,其中变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、厚壁菌门与拟杆菌门是优势类群,它们在森林、现代茶园和古茶园土壤中的相对丰度累计分别达91.86%、82.48%和77.08%;伯克霍尔德氏菌目、根瘤菌目是优势菌群,其平均丰度分别达13.91%和8.17%,黄单胞菌目、红螺菌目、芽孢杆菌目、放线菌目和拟杆菌目等12个目的丰度较高,达2%以上;PCA分析表明:森林、现代茶园和古茶园土壤的细菌群落结构差异明显,除景迈山外,主要优势细菌丰度依次为:古茶园>现代茶园>森林,古茶园土壤细菌多样性有增强趋势.
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PCR-DGGE
16S rDNA
克隆技术
土壤细菌多样性
实验技术
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土壤细菌多样性
末端测序
16S rRNA基因克隆文库
宏基因组文库
基于16S rRNA基因序列对不同土壤细菌群落的差异性分析
法医病理学
法医遗传学
土壤微生物学
DNA,细菌
RNA,核糖体,16S
生物多样性
高通量测序
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文献信息
篇名
基于16S rDNA测序对茶园土壤细菌群落多样性的研究
来源期刊
生态学报
学科
关键词
茶园土壤
细菌
宏基因组
高通量测序
多样性
年,卷(期)
2019,(22)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
8452-8461
页数
10页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.5846/stxb201808141733
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李永梅
云南农业大学资源与环境学院
95
1284
18.0
32.0
2
马燕
云南农业大学龙润普洱茶学院
17
74
5.0
8.0
3
杨广容
云南农业大学龙润普洱茶学院
16
122
7.0
10.0
4
吕才有
云南农业大学龙润普洱茶学院
53
305
9.0
15.0
5
蒋宾
云南农业大学龙润普洱茶学院
5
2
1.0
1.0
6
谢瑾
云南农业大学龙润普洱茶学院
7
57
4.0
7.0
7
马会杰
云南农业大学龙润普洱茶学院
3
2
1.0
1.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
版权信息
全文
全文.pdf
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
(368)
参考文献
(29)
节点文献
引证文献
(2)
同被引文献
(42)
二级引证文献
(0)
1955(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1969(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1980(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1985(1)
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二级参考文献(1)
1986(2)
参考文献(0)
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1987(5)
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1991(5)
参考文献(0)
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1992(7)
参考文献(0)
二级参考文献(7)
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参考文献(0)
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参考文献(0)
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1996(10)
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二级参考文献(10)
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参考文献(0)
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2020(2)
引证文献(2)
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研究主题发展历程
节点文献
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细菌
宏基因组
高通量测序
多样性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生态学报
主办单位:
中国生态学学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1000-0933
CN:
11-2031/Q
开本:
16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1981-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
14991
总下载数(次)
0
总被引数(次)
516896
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