珍稀濒危植物卵叶羌活自然群体遗传变异的地理分布研究

• 作者: 何颖 刘鸿宴 房敏峰 拓佩佩 景湘婷 李忠虎 梁如韵 王久霞 王宁 董鹏斌
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 卵叶羌活 多态性 遗传变异 群体结构 微卫星标记
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2461-2466
• 页数: 6页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2019.10.029

摘要

目的 检测珍稀濒危药用植物卵叶羌活自然群体遗传变异的地理分布式样和结构.方法 利用二代简化基因组测序技术开发卵叶羌活的微卫星分子标记(SSR)引物,并对覆盖卵叶羌活整个自然地理分布范围的群体样品进行遗传多态性分析.结果 通过基因组de novo组装共获得了780条含SSR位点的基因片段序列;筛选出10对具有较高多态性的SSR标记引物,对卵叶羌活整个自然地理分布区的6个群体共105个样品进行遗传变异分析,发现每条引物的等位基因数(No)在1～6(平均值为3.530);每个群体的平均观测杂合度范围在0.305～0.457,说明卵叶羌活具有中到高度水平的遗传变异.基于Bayesian的群体结构分析表明,卵叶羌活的6个地理群体可以分为2个大的遗传分组,两组之间存在着一定程度的基因交流或遗传渐渗.结论 二代高通量简化基因组测序技术极大丰富了珍稀濒危植物卵叶羌活的SSR数据库,其自然群体遗传变异式样可能与该物种较长的进化历史以及不同地理群体之间长距离的花粉扩散有关.