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1株来源于茅台酒酿造过程宛氏拟青霉MTDF-01的全基因组测序及分析
1株来源于茅台酒酿造过程宛氏拟青霉MTDF-01的全基因组测序及分析
作者:
刘延峰
堵国成
张巧玲
李江华
杨帆
王和玉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
茅台酒
拟青霉
全基因组测序
基因注释
摘要:
为深入了解宛氏拟青霉(Paecilomyces variotii)在酱香型白酒生产过程中代谢机理,为今后进一步挖掘及调控P.variotii在白酒酿造过程中代谢提供必要生物信息学基础.通过PacBio RS Ⅱ测序平台对P.variotii MTDF-01进行全基因组测序,并且对测序数据进行基因组组装、基因预测和功能注释、碳水化合物基因预测、次级代谢产物合成基因簇预测,以及与己报道全基因组序列的分离于土壤中的耐甲醛P.variotii No.5进行比较基因组分析和共线性分析.基因组拼接得到19个基因组骨架和19个重叠群,总长度为30 833 540 bp,GC平均含量为47.46%.基因组中预测到8 815个基因、5 044个简单重复序列,221个tRNA,49个rRNA.总共注释基因8 662个,其中淀粉和纤维素水解酶基因分别有60个和165个,次级代谢产物合成基因簇23个.P.variotii MTDF-01与P.variotii No.5基因组存在翻转、异位等基因组重排,两者基因组共存在16 414处单核苷酸碱基突变,其中有525个碱基缺失,335个碱基插入,15 554个单碱基替换.本研究利用PacBio RS Ⅱ测序平台获得了P.variotii MTDF-01的全基因组信息,并且分析P.variotii MTDF-01的潜在功能,为深入了解P.variotii在白酒生产过程中的代谢机理提供了遗传信息基础,对今后酱香型白酒中风味和健康物质的调控研究具有重要意义.
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文献信息
篇名
1株来源于茅台酒酿造过程宛氏拟青霉MTDF-01的全基因组测序及分析
来源期刊
食品科学
学科
工学
关键词
茅台酒
拟青霉
全基因组测序
基因注释
年,卷(期)
2019,(24)
所属期刊栏目
生物工程
研究方向
页码范围
185-192
页数
8页
分类号
TS261.1
字数
7358字
语种
中文
DOI
10.7506/spkx1002-6630-20181008-036
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
堵国成
江南大学工业生物技术教育部重点实验室
339
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2
李江华
江南大学工业生物技术教育部重点实验室
78
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刘延峰
江南大学工业生物技术教育部重点实验室
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全基因组测序
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研究来源
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研究去脉
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食品科学
主办单位:
北京食品科学研究院
出版周期:
半月刊
ISSN:
1002-6630
CN:
11-2206/TS
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区禄长街头条4号
邮发代号:
2-439
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
24602
总下载数(次)
47
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