海南五指山猪TLR4基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘海隆 张艳 林哲敏 谭树义 黄丽丽
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 五指山猪 TLR4基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 41-46
• 页数: 6页
• 分类号: S828.1|Q785
• 字数: 3772字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.08.009

摘要

为获得海南五指山猪TLR4基因序列并分析其分子结构特征,以GenBank中猪的TLR4基因序列为参考序列,采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析.结果显示,获得的五指山猪TLR4基因DNA序列长10435 bp,其中编码区全长2526 bp,共编码841个氨基酸;与GenBank中发布的普通猪的TLR4基因序列相比,存在38处突变(其中有2处突变位于编码区);与普通猪、牛、绵羊、犬、马、猕猴、人、黑猩猩、小鼠和鸡的同源性分别为99.9％ 、80.7％ 、79.9％ 、74.8％ 、74.7％ 、73.1％ 、73％ 、72.7％ 、62.5％ 、43.4％;五指山猪TLR4编码的蛋白属于分泌性蛋白和跨膜蛋白,具有亲水性,有8个糖基化修饰位点、17个丝氨酸(ser)、7个苏氨酸(Thr)及8个酪氨酸(TYR)磷酸化位点;氨基酸系统进化树分析表明,不同物种TLR4基因在进化过程中具有较高的保守性.该结果为进一步深入研究TLR4基因的功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭树义	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	35	96	3.0	9.0
2	林哲敏	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	12	50	4.0	6.0
4	张艳	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	42	74	3.0	5.0
8	刘海隆	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	54	93	5.0	7.0
11	黄丽丽	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	28	68	5.0	8.0