藏药川西獐牙菜中SmMK基因的克隆及生物信息分析

• 作者: 冯林林 向蓓蓓 孙继奇 朱晔荣 李晓雪 王勇 白艳玲 马琳
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 川西獐牙菜 甲羟戊酸激酶 基因克隆 生物信息学分析 原核表达
• 年，卷（期）: 2019,（13）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3169-3177
• 页数: 9页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2019.13.025

摘要

目的 了解川西獐牙菜Swertia mussotii Franch甲羟戊酸途径中的关键酶甲羟戊酸激酶基因(MK)的功能,并进一步推进川西獐牙菜中的甲羟戊酸途径的研究.方法 根据川西獐牙菜的转录组信息,获得了川西獐牙菜MK (SmMK)基因的全长cDNA序列,并且设计了特异性引物,利用RT-PCR对该基因进行了克隆;利用生物信息学方法,对SmMK基因的序列进行分析;构建原核表达载体MBP-SmMK,转入大肠杆菌Rosetta (DE3)中,然后对SmMK基因进行了原核表达,并对其进行了纯化.结果 SmMK基因cDNA全长为1 164bp,共编码387个氨基酸.SmMK与其他植物中的MK具有较高相似性.对其信号肽、跨膜区域、蛋白定位及二级结构和三维构象进行了预测分析.SDS-PAGE检测表明所纯化蛋白与预期蛋白的大小相一致,为40 970.结论 为进一步研究川西獐牙菜中MK的功能奠定了基础,并为进一步研究川西獐牙菜中的甲羟戊酸途径,提高川西獐牙菜中类异戊二烯化合物的产量提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王勇	南开大学生命科学学院	82	972	19.0	28.0
2	白艳玲	南开大学生命科学学院	60	310	10.0	15.0
3	马琳	天津中医药大学中药学院	75	551	11.0	21.0
4	朱晔荣	南开大学生命科学学院	29	211	8.0	14.0
5	向蓓蓓	天津中医药大学中药学院	14	24	2.0	4.0
6	李晓雪	南开大学生命科学学院	7	9	1.0	3.0
7	孙继奇	南开大学生命科学学院	3	1	1.0	1.0
8	冯林林	天津中医药大学中药学院	1	0	0.0	0.0