五加科药用植物鲨烯合酶的适应性进化分析

• 作者: 国红玉 张妍彤 朱金丽 王卓 邢朝斌
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 五加科 鲨烯合酶 适应性进化 SLAC FEL REL
• 年，卷（期）: 2019,（14）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3413-3419
• 页数: 7页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2019.14.022

摘要

目的 对五加科药用植物的鲨烯合酶(squalene synthase,SS)进行适应性进化分析.方法 利用PAML软件的分支模型、位点模型、分支-位点模型以及MEC模型、SLAC、FEL和REL等方法对五加科7种药用植物的23条SS基因进行适应性进化分析.结果 在PAML与MEC模型的分析中发现多数分支与位点处于较强的负选择下,未发现正选择位点;通过SLAC、FEL和REL分析同样显示存在大量的负选择位点,仅412P、413N、415K为正选择位点.结论 负选择对五加科SS基因起主导作用,而发现的412P、413N、415K位点可能与SS的活性有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张妍彤	华北理工大学生命科学学院	5	4	1.0	2.0
2	邢朝斌	华北理工大学生命科学学院	28	59	5.0	6.0
3	国红玉	华北理工大学生命科学学院	10	15	2.0	3.0
4	王卓	华北理工大学药学院	17	20	3.0	3.0
8	朱金丽	华北理工大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0