怀菊转录组分析及木犀草苷合成关键酶基因的挖掘

• 作者: 李曼 李询 董诚明 邢冰 魏硕
• 来源期刊: 中药材
• 学科: 医学
• 关键词: 怀菊 转录组 木犀草苷 关键酶基因 测序
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 资源与鉴别
• 页码范围: 2767-2774
• 页数: 8页
• 分类号: R282.71
• 语种: 中文
• DOI: 10.13863/j.issn1001-4454.2019.12.007

摘要

目的:对怀菊进行转录组学分析,探索木犀草苷合成的关键酶基因.方法:采用Illumina Hiseq Xten对怀菊离体培养阶段的愈伤组织、芽点、幼苗进行转录组测序,通过生物信息学分析,探索怀菊生长发育过程的整个转录水平调控情况及木犀草苷合成的关键酶基因.结果:经过测序质量控制,共得到83.67 Gb Clean Data,Trinity组装共得到302 379条Unigene,Unigene的总长度为164 773 301.将Unigene序列与NR、Swiss-Prot、GO、COG、KOG、eggNOG 4.5、KEGG数据库比对,获得130 966条Unigene的注释信息.筛选出9条PAL序列、5条CHS序列、4条CHI序列.对组织培养阶段黄酮合成途径相关的基因表达量进行统计分析,从中筛选出13条与木犀草苷含量变化趋势一致的基因.结论:分析怀菊转录组数据有利于探索木犀草苷的生物合成机制,可为之后通过分子技术调控关键酶基因提高菊花中木犀草苷的含量、提高怀菊的品质提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董诚明	河南中医药大学药学院	140	944	15.0	24.0
5	邢冰	河南中医药大学药学院	8	5	1.0	2.0
6	魏硕		3	0	0.0	0.0
7	李询	河南中医药大学药学院	8	1	1.0	1.0
8	李曼	河南中医药大学药学院	13	7	1.0	2.0