43种植物CaM1基因密码子使用特征及遗传差异分析

• 作者: 刘永伟 周硕 李晨辉 杜进民 杨帆 焦义然 董福双 赵子捷 陈文烨
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: CaM1 密码子偏性 遗传距离 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 28-32
• 页数: 5页
• 分类号: S188
• 字数: 3608字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.05.008

摘要

为深入了解不同类植物CaM1基因(calmodulin 1,简称CaM1)在抵抗逆境进化过程所形成的密码子的使用特征和遗传差异.运用CodonW、BioEdit和MEGA软件对43种植物序列进行分析,并构建系统发育树.结果表明,CaM1基因对密码子的使用具有极强的偏好性,CUC、AUC、UCU、CCA、ACU、UGA为其最优密码子,禾本目植物更偏好使用G/C碱基.G、C碱基含量和位置是引起CaM1基因密码子偏性的主要原因.遗传距离分析表明,山柑目与白花菜目之间的亲缘关系最近,豆目和无患子目间的亲缘关系次之,与聚类分析结果相符.