基于培养基法和高通量测序法分析冷藏小龙虾优势腐败菌

• 作者: 余海霞 姚洁玉 杨水兵 江杨阳 胡亚芹
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 工学
• 关键词: 小龙虾 优势腐败菌 培养基法 高通量测序
• 年，卷（期）: 2019,（16）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 130-136
• 页数: 7页
• 分类号: TS254.4
• 字数: 5022字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-20180718-229

摘要

为揭示4℃冷藏小龙虾贮藏期间微生物菌群多样性及优势腐败菌种类,以传统培养基法作为对照,采用高通量测序技术分别鉴定小龙虾样品在鲜样期、腐败中期、腐败末期的腐败菌属,探究贮藏期间微生物菌群变化趋势.2种测序方法对比发现,高通量法检测到的菌属更具多样性,培养基法提取的腐败菌均包含在高通量测序菌属内.结果表明,培养基法提取优势腐败菌共11株,其中气单胞菌(Aeromonas jandaei)致腐能力最强,弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)致腐能力最弱;此外,高通量测序法显示希瓦氏菌(Shewanella sp.)、肉杆菌属(Carnobacterium sp.)、环丝菌属(Brochothrix sp.)、嗜冷菌属(Psychrobacter sp.)、漫游球菌属(Vagococcus sp.)、不动杆菌属(Acinetobacter sp.)等在腐败末期时的物种丰度为90.57％.2种方法比对可以确定,小龙虾的优势腐败菌有希瓦氏菌、肉食杆菌、环丝菌属、嗜冷菌属、漫游球菌属、不动杆菌属、气单胞菌、束毛球菌属(Trichococcus sp.)等.