鱼类Foxl3基因的生物信息学分析

• 作者: 姚竞杰 徐小博 徐萍 王三虎 申祥
• 来源期刊: 安徽农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: Foxl3 鱼类 性别决定与分化 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（17）
• 所属期刊栏目: 分子生物·遗传育种
• 页码范围: 16-17,89
• 页数: 3页
• 分类号: Q344
• 字数: 1782字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7731.2019.17.007

摘要

为进一步探明Foxl3的结构、功能信息,及其在鱼类性别决定和分化中的作用,利用生物信息学方法对欧洲黑鲈、青鳉、斑马鱼和虹鳟的Foxl3蛋白进行同源性、蛋白质理化性质、二级结构、功能结构域和三级结构分析.结果表明:欧洲黑鲈与青鳉、斑马鱼同源性较高,和虹鳟相似度不高,只有79％;鱼类的Foxl3蛋白分别编码269、264、260和296个氨基酸;该蛋白定位于细胞核,无明显信号肽和跨膜结构;主要的二级结构元件是α-螺旋和无规则卷曲,且α-螺旋所占百分比:虹鳟>青鳉>欧洲黑鲈>斑马鱼,无规则卷曲所占百分比:欧洲黑鲈>虹鳟>青鳉>斑马鱼;均包含1个Forkhead家族(FH superfamily)功能结构域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王三虎	河南科技学院动物科技学院	89	507	13.0	19.0
2	徐萍	新乡学院生命科学技术学院	5	5	1.0	2.0
3	姚竞杰	河南科技学院动物科技学院	7	1	1.0	1.0
4	徐小博	新乡学院生命科学技术学院	7	9	2.0	3.0
5	申祥	河南科技学院动物科技学院	1	0	0.0	0.0