灰毡毛忍冬LmPAL1基因的克隆及表达分析

• 作者: 刘湘丹 刘畅宇 周日宝 童巧珍 陈勋 陈娅 龙雨青
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 灰毡毛忍冬 苯丙氨酸解氨酶(PAL) 基因克隆 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 178-187
• 页数: 10页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2019.01.027

摘要

目的 克隆灰毡毛忍冬苯丙氨酸解氨酶(LmPAL1)基因全长序列,并进行生物信息学和表达模式分析.方法 提取灰毡毛忍冬花总RNA,通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)和RACE技术克隆LmPAL1基因的全长cDNA序列;运用相关软件对该基因序列进行生物信息学分析;利用qRT-PCR测定灰毡毛忍冬茎、叶和不同花期花中该基因的相对表达量.结果 克隆的LmPAL1基因开放阅读框(ORF)长度为2 145bp,编码714个氨基酸,生物信息学分析预测为亲水性蛋白,定位于叶绿体中,包含PAL shielding结构域(527～641 aa),并且含有PAL/HAL活性中心序列GT兀TASGDLVPLSYIAG(196～212 aa),与其他LmPAL1具有较高的相似度;LmPALl基因qRT-PCR结果显示,7个花期材料以金黄色开花期相对表达量较高;与茎、叶比,白色花蕾期花的相对表达量最高,叶的最低.结论 成功克隆了LmPAL1基因,为进一步研究该基因的功能以及遗传改良灰毡毛忍冬品质奠定基础,同时为探究灰毡毛忍冬绿原酸生物合成和调节机制提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周日宝	湖南中医药大学药学院	123	1166	19.0	27.0
2	童巧珍	湖南中医药大学药学院	98	767	14.0	22.0
3	刘湘丹	湖南中医药大学药学院	65	262	9.0	12.0
5	刘畅宇	湖南中医药大学药学院	7	12	2.0	3.0
8	陈勋	湖南中医药大学药学院	7	14	2.0	3.0
9	陈娅	湖南中医药大学药学院	6	10	2.0	3.0
10	龙雨青	湖南中医药大学药学院	4	4	2.0	2.0