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干旱胁迫下水稻转录因子表达变化
干旱胁迫下水稻转录因子表达变化
作者:
刘仁梅
徐辰峰
成立瑞
朱长保
林中正
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
水稻
敏感品种
耐旱品种
生物信息学分析
转录因子
摘要:
本研究是探索在干旱应激下水稻转录因子的变化及可能的调控机制.本研究整合GEO数据库中关于水稻耐旱研究的基因芯片数据,通过TAC软件对基因芯片数据分析筛选出差异基因,利用在线数据库DAVID 6.8和Plant TF DB筛选出相应的转录因子.敏感品种有9个转录因子表达方向一致(同时上调表达的有7个转录因子,下调的有2个转录因子),耐旱品种有34个转录因子表达方向一致(同时上调表达的有23个转录因子,下调表达的有11个转录因子).敏感品种和耐旱品种间有8个表达方向一致的重叠转录因子.干旱胁迫会显著影响转录因子的表达,不同水稻品种中,这些转录因子的表达既有较强的品种特异性,也有部分相似性.水稻可通过诱导和抑制转录因子的表达,来提高自身抗旱能力.
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文献信息
篇名
干旱胁迫下水稻转录因子表达变化
来源期刊
中国农学通报
学科
农学
关键词
水稻
敏感品种
耐旱品种
生物信息学分析
转录因子
年,卷(期)
2019,(6)
所属期刊栏目
生物科学
研究方向
页码范围
108-114
页数
7页
分类号
S511.03
字数
语种
中文
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研究来源
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中国农学通报
主办单位:
中国农学会
出版周期:
旬刊
ISSN:
1000-6850
CN:
11-1984/S
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区麦子店街22号楼中国农学会期刊处
邮发代号:
2-772
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
26902
总下载数(次)
53
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