基于新一代高通量测序技术分析拮抗酵母Cryptoccocus laurentii诱导处理樱桃番茄果实后转录组学的变化

• 作者: 唐琼 郑晓冬
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 罗伦隐球酵母 樱桃番茄 转录组学 实时荧光定量聚合酶链式反应
• 年，卷（期）: 2019,（18）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 55-62
• 页数: 8页
• 分类号: Q945.8
• 字数: 8297字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-20180830-322

摘要

罗伦隐球酵母(Cryptococcus laurentii)作为生物激发子,能显著诱导采后樱桃番茄对灰葡萄孢(Botrytis cinerea)的抗性响应,但其防治机制尚未完全明确.本实验以樱桃番茄为材料,利用新一代高通量测序技术Illumina HiSeqTM4000对罗伦隐球酵母处理及水对照处理的番茄果肉组织进行转录组测序,采用生物信息学方法对差异基因进行功能注释和通路分析,并利用实时荧光定量聚合酶链式反应(real time-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术对随机选取的差异表达基因进行验证.结果表明,樱桃番茄果实经过罗伦隐球酵母诱导处理48 h后,共有3141个基因差异表达,上、下调表达基因分别为1689个和1452个,这些差异表达基因涉及多个代谢路径,揭示罗伦隐球酵母对番茄的诱导作用是一个多代谢路径参与的调控过程.此外,RT-qPCR验证结果与转录组分析结果趋势一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑晓冬	浙江大学生物系统工程与食品科学学院	79	1244	18.0	31.0
2	唐琼	浙江大学生物系统工程与食品科学学院	1	1	1.0	1.0