211例中国南方地区结核分枝杆菌48-locus MIRU-VNTR基因分型分析

• 作者: 刘志辉 吴玲 孟繁荣 杨瑜 牛群 王楠 谢贝 雷杰 高俊文
• 来源期刊: 国际医药卫生导报
• 关键词: 结核分枝杆菌 MIRU-VNTR HGDI 基因分型
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 科研课题
• 页码范围: 1374-1378,1383
• 页数: 6页
• 字数: 3975字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-1245.2019.09.007

摘要

目的 探讨适合于中国南方地区结核分枝杆菌基因分型的MIRU-VNTR基因分型技术.方法 复苏培养211例结核分枝杆菌,提取DNA后PCR扩增48个VNTR位点进行48-locus MIRU-VNTR基因分型分析,计算Hunter Gaston Discriminatory Index(HGDI)并以其大于0.6为标准确定适于中国南方地区结核分枝杆菌基因分型分析的位点组合.结果 48个位点中30个位点能够得到稳定扩增,HGDI值介于0.09和0.87之间.其中VNTR3192、VNTR2996、VNTR2461、VNTR4052、VNTR4155、VNTR 1895、VNTR1955、VNTR0960、VNTR4348、VNTR0595、VNTR 1305、VNTR0154、VNTR2687、VNTR2401、VNTR2347、VNTR 1907等16个VNTR位点HGDI值均高于0.6,属于高分辨力位点,16位点组合总HGDI大于0.98.结论 中国南方地区进行结核分枝杆菌MIRU-VNTR基因分型相关研究时,应至少将上述16个位点纳入分型分析之中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘志辉		98	522	10.0	19.0
2	谢贝	广州市胸科医院肺部疾病研究所	23	67	6.0	7.0
3	孟繁荣	广州市胸科医院肺部疾病研究所	25	72	5.0	7.0
4	高俊文	广州市胸科医院肺部疾病研究所	6	11	2.0	3.0
5	杨瑜	广州市胸科医院肺部疾病研究所	9	7	1.0	2.0
6	吴玲	广州市胸科医院肺部疾病研究所	10	24	3.0	4.0
7	王楠	广州市胸科医院肺部疾病研究所	9	12	2.0	3.0
8	雷杰	广州市胸科医院肺部疾病研究所	9	11	2.0	3.0
9	牛群	广州市胸科医院肺部疾病研究所	8	10	2.0	3.0