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花生黑腐病菌碳水化合水解酶的全基因组分析
花生黑腐病菌碳水化合水解酶的全基因组分析
作者:
周荃
罗梅
董章勇
陈欣瑜
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
花生黑腐病菌
寄生帚梗柱孢霉
水化合水解酶
全基因组
分析
摘要:
花生黑腐病(Cylindrocladium black rot of peanut,简称CBR)是由寄生帚梗柱孢霉(Cylindrocladium parasiticum Crous,Wingfield&Alfenas)侵染引起的一种严重的检疫性病害,给农业生产造成了巨大的经济损失.以笔者所在实验室前期获得的花生黑腐病菌全基因组18 366个蛋白序列为基础,利用CAZymes Analysis Toolkit预测程序进行注释,共获得注释碳水化合水解酶(CAZymes)1 197个,分为6个家族,分别为191个辅助酶(auxiliary activities,简称AAs)、137个糖基转移酶(glycosyl transferases,简称GTs)、422个糖苷水解酶(glycoside hydrolases,简称GHs)、48个多糖裂解酶(polysaccharide lyases,简称PLs)、300个碳水化合物酯酶(carbohydrate esterases,简称Ces)、99个碳水化合物绑定结构(carbohydrate-binding modules,简称CBMs).根据Blast2GO对花生黑腐病菌CAZymes蛋白的功能分析结果,将CAZymes分为3大类分别为生物进程、细胞成分、分子功能类.该研究可为进一步解析CAZymes的功能奠定基础,为深入研究该致病菌侵染植物的作用机制提供了一定的理论依据.
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水稻
内容分析
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文献信息
篇名
花生黑腐病菌碳水化合水解酶的全基因组分析
来源期刊
江苏农业科学
学科
农学
关键词
花生黑腐病菌
寄生帚梗柱孢霉
水化合水解酶
全基因组
分析
年,卷(期)
2019,(22)
所属期刊栏目
生物技术
研究方向
页码范围
52-56
页数
5页
分类号
S435.652
字数
3785字
语种
中文
DOI
10.15889/j.issn.1002-1302.2019.22.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
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1
罗梅
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水化合水解酶
全基因组
分析
研究起点
研究来源
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期刊影响力
江苏农业科学
主办单位:
江苏省农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
1002-1302
CN:
32-1214/S
开本:
大16开
出版地:
南京市孝陵卫钟灵街50号
邮发代号:
28-10
创刊时间:
1973
语种:
chi
出版文献量(篇)
24128
总下载数(次)
53
总被引数(次)
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