原发性胆汁性肝硬化患者外周血长链非编码RNA差异表达分析

• 作者: 付雪 叶震璇 向国艳 张华 李红梅 樊佳
• 来源期刊: 重庆医学
• 学科: 医学
• 关键词: 肝硬化,胆汁性 长链非编码RNA 微RNAs
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 论著·临床研究
• 页码范围: 1149-1154
• 页数: 6页
• 分类号: R446.6
• 字数: 3748字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2019.07.017

摘要

目的 探讨原发性胆汁性肝硬化(PBC)患者外周血单个核细胞(PBMC)中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)在PBC发病中的作用.方法 利用Illumina高通量测序技术检测5例健康人和5例PBC患者外周血PBMC中lncRNA与mRNA的表达水平,筛选差异表达的lncRNA与mRNA.对差异表达的mRNA进行基因本体(GO)功能分析、信号转导通路富集分析(KEGG分析)及蛋白互作网络分析,寻找与PBC相关的mRNA.靶基因Cis-和Trans-分析预测lncRNA和mRNA的关系,寻找与PBC相关的lncRNA,并通过实时荧光定量PCR进行验证(采用25例健康人和25例PBC患者).结果 共检测到差异表达的mRNA5 143个(2 318个上调和2 825个下调),差异表达的lncRNA 716个(367个上调和349个下调).GO与KEGG分析发现,差异表达的mRNA与炎症、免疫活性、代谢及TCR信号通路、核因子-κB(NF-κB)信号通路、趋化因子信号通路等相关.其中早期生长反应因子1 (EGR1)参与了炎症、免疫细胞活化、TCR信号通路等,可能与PBC的发生相关.Cis-分析发现lncRNA NONHSAT250451.1对EGR1具有靶向调控作用,其可能参与PBC的发生.实时荧光定量PCR结果显示lncRNA NONHSAT250451.1与EGR1在PBC患者PBMC中的表达水平较对照组分别高出7.26、3.91倍(P＜0.05),与测序结果一致.结论 lncRNA NONHSAT250451.1可能参与PBC的发生.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张华	贵州医科大学医学检验学院	41	175	7.0	11.0
5	李红梅	贵州医科大学医学检验学院	9	1	1.0	1.0
6	向国艳	贵州医科大学临检教研室	2	1	1.0	1.0
7	樊佳	西南医科大学附属医院中医医院检验科	3	1	1.0	1.0
8	叶震璇	贵州医科大学医学检验学院	1	0	0.0	0.0
9	付雪	贵州医科大学医学检验学院	1	0	0.0	0.0