毛果杨AGO基因家族生物信息学分析

• 作者: 张丽华 王婷 王晓立 陈群 韩浩章
• 来源期刊: 安徽农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 毛果杨 AGO蛋白 基因家族 生物信息
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 分子生物·生理生化·组织培养
• 页码范围: 12-15
• 页数: 4页
• 分类号: S792.11
• 字数: 3487字
• 语种: 中文

摘要

Argonautes(AGOs)蛋白是生物有机体中普遍存在的一类比较保守的蛋白质,在不同物种的RNAi及相关的途径中具有十分重要的功能,也调控着模式植物拟南芥的生长发育过程.该研究利用AGO蛋白的保守域在毛果杨基因组中进行同源比对,鉴定出毛果杨AGO基因家族成员13个,并对其成员进行了理化性质分析、motif结构比对、进化树构建、基因表达分析等.结果表明:毛果杨AGO基因家族成员基因长度为2463～3189bp,编码的蛋白质具有保守的Piwi、PAZ、DUF1785结构域.PtAGO基因分布于第1、6、8、9、10、12、14、15、16条染色体上,存在着串联重复序列.AGO蛋白定位于叶绿体、细胞核和胞质中,偏碱性和亲水性,具有较高的脂溶指数、不稳定性.基因组织表达分析表明,毛果杨PtAGO成员在不同组织中的表达有明显差异,在与木材形成相关的组织、器官中有较高的表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张丽华	宿迁学院建筑工程学院实验中心	47	129	6.0	8.0
2	王晓立	宿迁学院建筑工程学院实验中心	73	277	9.0	12.0
3	韩浩章	宿迁学院建筑工程学院实验中心	91	302	9.0	12.0
4	陈群	宿迁学院建筑工程学院实验中心	17	19	4.0	4.0
5	王婷		2	1	1.0	1.0