病毒性肝炎肝硬化发病关键基因及相互作用的生物信息学研究

• 作者: 刘传苗 张莉 徐葵花 翟蕙 陈家盛
• 来源期刊: 齐齐哈尔医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 病毒性肝炎 肝硬化 基因芯片 生物信息
• 年，卷（期）: 2019,（19）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 2387-2391
• 页数: 5页
• 分类号: R575
• 字数: 3777字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-1256.2019.19.004

摘要

目的 筛选病毒性肝炎肝硬化发生发展中的关键基因,分析其相互之间的作用.方法 本研究从公共基因芯片数据库(GEO)下载病毒性肝炎肝硬化相关芯片数据,利用R语言中相关软件筛选出表达差异基因,分别对差异基因进行Gene Ontology功能分析、KEGG代谢通路分析以及蛋白相互作用网络分析.结果 本研究从GEO数据库中筛选出2组基因芯片进行分析,发现共同差异基因307个,其中上调基因62个、下调基因245个.富集分析表明差异基因在信号传导、免疫反应等方面与肝硬化的发生发展有关,通过粘着斑通路、细胞黏附分子通路有关影响其进程;并筛选得到HLA-DMA、MYL9、COL3A1、C1QA等28个与肝硬化发病关系密切的基因、构建了相应的蛋白相互作用网络.结论 利用生物信息学方法能有效的分析基因芯片数据、筛选出目标基因,为病毒性肝炎肝硬化的防治、诊断和治疗等提供新的思路和相关靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张莉	蚌埠医学院第一附属医院感染性疾病科	116	365	8.0	12.0
2	刘传苗	蚌埠医学院第一附属医院感染性疾病科	30	66	5.0	7.0
3	徐葵花	蚌埠医学院第一附属医院感染性疾病科	16	51	5.0	6.0
4	翟蕙	蚌埠医学院第一附属医院感染性疾病科	6	17	1.0	4.0
5	陈家盛	蚌埠医学院第一附属医院感染性疾病科	10	19	2.0	4.0