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甘蓝型油菜主花序有效角果数QTL定位和候选基因筛选
甘蓝型油菜主花序有效角果数QTL定位和候选基因筛选
作者:
徐飞
曾焕
耿鑫鑫
黄伊雪
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甘蓝型油菜
主花序有效角果数
QTL定位
候选基因
摘要:
以DH-7-9(角果数多)×DH-G-42(角果数少)杂交后代连续自交的重组自交系(RIL)的190个家系为材料,在西宁和武汉2个环境下进行主花序有效角果数性状分析.结果 表明,该RIL群体的主花序有效角果数表现出连续变异并且符合正态分布.利用已构建的遗传连锁图,结合2个年份2个环境下主花序有效角果数性状表型数据,采用WinQTL Cartographer 2.5软件的复合区间作图法(composite interval mapping,简称CIM)进行QTL定位和效应估计.结果 在2个环境下共检测到6个与主花序有效角果数、性状相关的QTL,单个QTL可解释的表型变异范围为7.9%~24.39%.其中qESN-W-C5的贡献率达到24.39%,LOD值为12.97,位于C5染色体上,因此视其为该主花序有效角果数性状的主效QTLs.将拟南芥中已发表的角果数相关的3个基因与主效QTL置信区间对应的油菜基因组上104个基因进行同源比较分析,结果主效QTL区域内1个候选基因BnaC05g32840D与拟南芥角果数基因AT3G19820具有较高的同源性,推测其为油菜主花序有效角果数候选基因.
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早熟
QTL作图
候选基因
基于QTL定位和全基因组关联分析筛选甘蓝型油菜株高和一次有效分枝高度的候选基因
甘蓝型油菜
株高
一次有效分枝高度
基因定位
候选基因筛选
整合GWAS和WGCNA筛选鉴定甘蓝型油菜生物产量候选基因
GWAS
WGCNA
RNA Seq
甘蓝型油菜
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
甘蓝型油菜主花序有效角果数QTL定位和候选基因筛选
来源期刊
江苏农业科学
学科
农学
关键词
甘蓝型油菜
主花序有效角果数
QTL定位
候选基因
年,卷(期)
2019,(7)
所属期刊栏目
生物技术
研究方向
页码范围
38-41
页数
4页
分类号
S634.303.2
字数
3758字
语种
中文
DOI
10.15889/j.issn.1002-1302.2019.07.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
徐飞
武汉生物工程学院应用生物技术研究中心
20
29
3.0
5.0
2
耿鑫鑫
武汉生物工程学院应用生物技术研究中心
4
1
1.0
1.0
3
曾焕
武汉生物工程学院应用生物技术研究中心
1
1
1.0
1.0
4
黄伊雪
武汉生物工程学院应用生物技术研究中心
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二级引证文献(0)
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2020(2)
引证文献(0)
二级引证文献(2)
研究主题发展历程
节点文献
甘蓝型油菜
主花序有效角果数
QTL定位
候选基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏农业科学
主办单位:
江苏省农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
1002-1302
CN:
32-1214/S
开本:
大16开
出版地:
南京市孝陵卫钟灵街50号
邮发代号:
28-10
创刊时间:
1973
语种:
chi
出版文献量(篇)
24128
总下载数(次)
53
总被引数(次)
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