基于16S和COⅠ基因探讨岩扇贝在扇贝科中的分类地位

• 作者: 刘钢 印明昊 曹善茂 朱丽洁 王尧 聂鸿涛 邹建威
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 岩扇贝 COⅠ基因 16S rRNA 密码子偏好性 系统进化树分析
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 28-31
• 页数: 4页
• 分类号: S917.4
• 字数: 3234字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.07.007

摘要

采用PCR扩增和序列测定等技术,对岩扇贝(Crassadoma gigantea)线粒体DNA 16S rRNA和COⅠ基因片段进行初步研究,得到16S rRNA基因片段的大小在613.0～634.0bp之间,A、T(U)、G、C的平均含量分别为26.5％、29.7％、24.5％、19.3％;COⅠ基因片段的大小为660bp,碱基A、T、G、C的平均含量分别为17.2％、40.3％、27.2％、15.3％.16S基因在岩扇贝中偏好使用GUU、UUG、AUU、ACG、UAU、CAA、GAG、UUU、UCU、GAU、GGU、GAG、AGG和GGA等25个密码子.COⅠ系统进化树表明,与岩扇贝亲缘关系最近的是柿孔扇贝(Azumapecen farreri),其次是冰岛扇贝(Chlamys islandica).16S系统进化树亲缘关系由近到远依次是北美扇贝(Patinopecten caurinus)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)、Chlamys islandica.