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花生WRI1基因家族的全基因组与表达谱分析
花生WRI1基因家族的全基因组与表达谱分析
作者:
孙金波
李凤丽
杨利
王兴军
石素华
赵术珍
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
花生
WRI1转录因子
生物信息学分析
基因表达
摘要:
花生(Arachis hypogaea L.)是世界范围内重要的油料与经济作物之一.转录因子WRIN-KLED1(WRI1)在植物油脂生物合成途径中起着重要作用.尽管花生基因组序列已经公布,但国内外尚缺乏对花生中WRI1基因家族的全基因组分析.本研究从二倍体花生野生种和四倍体栽培种的参考基因组中鉴定出20个WRI1转录因子,经分析表明它们均为亲核蛋白,位于细胞核内,二级结构主要由无规卷曲和α-螺旋组成,20个WRI1基因的结构中含有5~8个内含子.系统发育分析表明,花生WRI1基因与其他物种的WRI1成员有密切关系.转录组数据表明种子中WRI1表达高于其他组织,qRT-PCR结果进一步表明WRI1表达随种子成熟水平逐渐增加.本文对花生基因组中WRI1全基因组的鉴定和表达分析,为进一步探讨WRI1基因在种子发育过程中的功能提供了依据.
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篇名
花生WRI1基因家族的全基因组与表达谱分析
来源期刊
花生学报
学科
农学
关键词
花生
WRI1转录因子
生物信息学分析
基因表达
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
9-18
页数
10页
分类号
Q786|S565.2
字数
4709字
语种
中文
DOI
10.14001/j.issn.1002-4093.2020.01.002
五维指标
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花生
WRI1转录因子
生物信息学分析
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
花生学报
主办单位:
山东省花生研究所
出版周期:
季刊
ISSN:
1002-4093
CN:
37-1366/S
开本:
16开
出版地:
山东省青岛市李沧区浮山路126号山东省花生研究所
邮发代号:
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
1176
总下载数(次)
1
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