两株从三带喙库蚊中分离的toti病毒变异株的分子特征

• 作者: 代科 左曙青 张久松 彭红红 王媛媛 童贻刚 赵秋敏
• 来源期刊: 寄生虫与医学昆虫学报
• 关键词: Toti病毒 病毒分离 高通量测序 全基因组
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 著述
• 页码范围: 20-25
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-0507.2020.01.004

摘要

从上海捕获的三带喙库蚊中新分离到2株toti病毒,暂命名为Toti病毒ND3(TOV_ND3)和Toti病毒FD17(TOV_FD17).利用高通量测序平台测定其全基因组序列.结果表明,TOV_ND3和FD17的基因组长度分别为7612和7611 bp,编码2个蛋白,包括1个衣壳蛋白(CP)和1个RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp).TOV_ND3的全基因组序列与Culex tritaeniorhynchus NJ2(CTV_NJ2)的同源性最高,然而TOV_FD17与Omono river病毒AK4(ORV-AK4)的同源性最高,分别为84.6％和84.9％,两株之间核苷酸同源性为74.1％.系统发育分析表明,这两株新分离的病毒株属于Toti病毒科的变异株.