胰腺癌诊断和预后关键生物标志物的筛选鉴定和综合分析

• 作者: 李菁媛 杨静 柳兴源
• 来源期刊: 肿瘤防治研究
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学分析 差异表达基因 胰腺癌
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 46-51
• 页数: 6页
• 分类号: R735.9
• 字数: 3571字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2020.19.0743

摘要

目的 筛选鉴定胰腺癌进展过程的关键基因和途径,并进行综合分析.方法 利用GEO2R对胰腺癌基因表达集合GSE15471、GSE16515、GSE28735、GSE62165中差异表达基因(DEGs)进行筛选和识别,运用DAVID数据库进行GO分析和KEGG通路分析.然后应用STRING数据库构建了蛋白质相互作用(PPI)网络,并使用Cytoscape和GEPIA对Hub基因进行了鉴定.用反转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)对这些Hub基因的mRNA水平进行定量分析.结果 筛选出181个上调差异表达基因(uDEGs)和64个下调差异表达基因(dDEGs),分析结果显示uDEGs和dDEGs在细胞成分(CC),生物过程(BP)和分子功能(MF)中分别富集,与多条信号通路密切相关.DEGs中degree得分较高的top 25基因.8个基因的差异表达可预测胰腺癌的预后不良.RT-qPCR结果显示这些基因在胰腺癌组织中均有差异表达发生.结论 MMP14、MMP1、MET、PLAU、ITGA2、KRT19、COL12A1和ITGA3是与胰腺癌进展有关的关键基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨静	锦州医科大学基础医学院	16	7	2.0	2.0
2	柳兴源	锦州医科大学基础医学院	1	0	0.0	0.0
3	李菁媛	锦州医科大学附属第一医院药学部	1	0	0.0	0.0