不同毒株犬瘟热病毒结构基因的通用扩增及序列测定

• 作者: 卜研 史一琚 廉士珍 朱言柱 胡博 薛向红 赵传芳 陈杰
• 来源期刊: 特产研究
• 学科: 农学
• 关键词: 通用引物 犬瘟热病毒 结构基因扩增
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 9-14
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65+5|Q786
• 字数: 3984字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16720/j.cnki.tcyj.2020.02.002

摘要

为了更准确、快速、高通量地追溯犬瘟热病毒流行毒株来源,揭示其进化规律,本研究分析比对了GenBank中已公布的23株犬瘟热病毒全基因组序列,针对6个结构基因的保守区设计了特异性通用引物,用于扩增犬瘟热病毒野毒株和疫苗株的6个结构基因.经过优化引物对的特异性、通用性、工作浓度及退火温度等,最终确定6对特异性通用扩增引物,对本室保存的3株疫苗毒CDV-3株、OR12株、CDV/R-20/8株,及2个流行毒HBF-1株和SD (14) 07株的6个结构蛋白基因进行RT-PCR通用扩增.取5μL扩增产物进行1％琼脂糖凝胶电泳,结果显示,以上述5株犬瘟热病毒的cDNA为模板,用6对通用引物扩增,分别获得6个特异性条带,大小与预期相符.选取疫苗毒CDV-3株和野毒HBF-1株N、P、M、F、H和L基因连接至pEASY-Blunt载体上,进行序列测定.测序结果显示,与GenBank中已公布的序列同源性均大于99.0％,证实筛选的6对特异性引物能够实现对犬瘟热病毒野毒株和疫苗株的不同结构基因的准确扩增,并获得精准序列.这提高了犬瘟热病毒检测鉴定的效率和特异性,有利于人们快速、准确地获取犬瘟热病毒未知毒株结构基因的序列,追溯病原来源和分析其进化规律,为疫苗研制提供思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	廉士珍	中国农业科学院特产研究所	16	20	2.0	4.0
2	朱言柱	中国农业科学院特产研究所	25	30	3.0	3.0
3	赵传芳	中国农业科学院特产研究所	19	22	3.0	3.0
4	卜研	中国农业科学院特产研究所	3	1	1.0	1.0
5	薛向红	中国农业科学院特产研究所	7	19	2.0	4.0
6	陈杰	中国农业科学院特产研究所	16	258	6.0	16.0
7	史一琚		1	0	0.0	0.0