貂源冠状病毒与2019新型冠状病毒的遗传进化关系

• 作者: 任林柱 杨艳玲 程世鹏
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 水貂冠状病毒 新型冠状病毒(HCoV-19) 基因组 遗传进化关系
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 流行病学
• 页码范围: 21-26
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3796字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2020.04.005

摘要

为进一步明确貂源冠状病毒与新型人冠状病毒HCoV-19的遗传进化关系,比较了NCBI上公布的3株水貂冠状病毒、5株雪貂冠状病毒以及人冠状病毒HCoV-19和SARS-Cov的全基因组、ORF1a、ORF1ab和病毒表面蛋白Spike的序列同源性,分析了其遗传进化关系,以及组成病毒的结构蛋白和非结构蛋白的种类、基因位置及氨基酸数量.结果显示:貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19全基因组、ORF1a、ORF1ab、Spike蛋白的相似性分别为68％、46.96％、52.44％、47.36％;貂源冠状病毒与HCoV-19不属于同一分支,且亲缘关系较远;同时,貂源冠状病毒与HCoV-19全基因组在蛋白组成、氨基酸数量、基因位置上均存在显著差异.结果表明,貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19不是同一种冠状病毒,此次在人群中流行的新型冠状病毒HCoV-19由貂源冠状病毒重组而成的可能性很小,因此可初步排除HCoV-19来源于水貂和雪貂的可能性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任林柱	吉林大学动物科学学院	39	95	5.0	8.0
2	程世鹏	中国农业科学院特产研究所	49	134	7.0	9.0
3	杨艳玲	中国农业科学院特产研究所	17	31	2.0	5.0