室内饲养与野外采集的松墨天牛幼虫microRNA表达谱比较分析

• 作者: 杨炳琰 赵莉蔺
• 来源期刊: 生物安全学报
• 关键词: 松墨天牛幼虫 高通量测序 野生 室内饲养 microRNA
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 90-98
• 页数: 9页
• 字数: 5364字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1787.2020.02.003

摘要

[目的]昆虫随着生长环境的变化常常会有不同的生物学特性,其表观遗传调控机制研究值得关注.松墨天牛是松树萎焉病中松材线虫的媒介昆虫,但松墨天牛在实验室饲养和野外的不同条件下,其形态及发育速率有较大的区别,其表观遗传响应机制并不明确.通过比较分析microRNA表达谱揭示室内饲养和野外采集松墨天牛幼虫之间的差异,以期为松墨天牛幼虫的表观遗传研究提供参考.[方法]使用illuminaHiSeq 2000平台进行microRNA高通量测序,得到了实验室饲养和野外采集松墨天牛老熟幼虫的表皮、中肠microRNA库.鉴定保守microRNA和预测新microRNA,并对microRNA进行差异表达分析、靶基因预测、靶基因GO注释和KEGG功能富集分析.[结果]在室内饲养的松墨天牛表皮、中肠中分别鉴定出16、14个microRNA;在野外生存的天牛表皮、中肠中均鉴定出13个microRNA.与表皮相比,中肠的miRNA的表达量更高.与野外采集相比,在室内饲养天牛的microRNA表达量更高.17个microRNA表达量在室内饲养与野外采集的天牛之间有显著差异,比如novel-mir-62127、novel-mir-184731、novel-mir-290819等有明显上调,novel-mir-251851等明显下调.差异表达的miRNA的靶基因的功能主要富集在氨基糖代谢、几丁质代谢等糖代谢和甘油磷脂代谢、脂肪酸代谢等脂代谢过程.[结论]室内饲养和野外采集松墨天牛老熟幼虫的microRNA库存在明显差异,且不同的组织microRNA表达谱存在明显差异,提示经历室内恒定培养条件的松墨天牛具有表观遗传调控特征,为进一步研究松墨天牛发育、代谢的microRNA调控机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵莉蔺	中国科学院动物研究所农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室	25	402	12.0	20.0
5	杨炳琰	中国科学院动物研究所农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室	1	0	0.0	0.0