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摘要:
目的 探讨趋化因子受体4(CXCR4)对胃癌患者预后相关性及潜在机制.方法 从TCGA数据库下载胃癌患者的RNA表达及临床数据,按CXCR4表达水平分为高表达组(188例)和低表达组(187例),比较2组患者生存时间、不同肿瘤分期胃癌患者的CXCR4表达水平;将患者所测的各个RNA表达水平逐一与CXCR4表达水平进行Pearson相关性分析,选取相关性最高的前50个基因;对筛选出的50个基因进行GO富集分析、KEGG通路富集分析以及所编码的蛋白质之间的相互作用.结果 CXCR4高表达组胃癌患者中位生存时间低于CXCR4低表达组(P<0.01).病理分期Ⅰ期患者CXCR4表达水平显著低于Ⅱ~Ⅳ期,T1期患者CXCR4表达水平显著低于T2~T4期,M0期患者CXCR4表达水平低于M1期(均P<0.05);N分期4组间CXCR4表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05).在检测的20225个基因中,有11623个基因与CXCR4存在相关性,选取与CXCR4表达相关系数最高的前50个基因,其中氢电压门控通道1和RCSD结构域1与CXCR4表达水平的相关系数最高(r=0.749、0.738,P<0.001).GO富集分析可见,主要涉及的生物学过程包括对刺激的反应、生物调节、细胞通讯,主要定位的细胞组分为膜、囊泡、细胞质,主要涉及的分子功能为蛋白质结合、分子换能器活动、酶调节剂活性.KEGG通路富集分析可见,主要涉及的信号通路为负性胸腺T细胞选择、B细胞活化参与免疫反应、免疫球蛋白介导的免疫反应;编码蛋白之间的相互作用网络可见,酪氨酸蛋白激酶BTK、胞质分裂蛋白2脱除剂、受体型酪氨酸蛋白磷酸酶C是处于网络核心的蛋白.结论 CXCR4高表达与胃癌患者远期生存率降低及肿瘤分级更高相关,这可能与其通过调控免疫系统而促进肿瘤细胞免疫逃逸有关.
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文献信息
篇名 趋化因子受体4与胃癌患者预后的相关性及潜在机制探索
来源期刊 解放军医药杂志 学科 医学
关键词 胃肿瘤 趋化因子受体4 生物信息学 预后 蛋白酪氨酸激酶类 年龄因素
年,卷(期) 2020,(2) 所属期刊栏目 肿瘤基础与临床
研究方向 页码范围 21-25,31
页数 6页 分类号 R735.2
字数 3198字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.2095-140X.2020.02.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 程明 上海市第四人民医院普外科 6 3 1.0 1.0
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节点文献
胃肿瘤
趋化因子受体4
生物信息学
预后
蛋白酪氨酸激酶类
年龄因素
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
解放军医药杂志
月刊
2095-140X
13-1406/R
大16开
河北省石家庄市中山西路398号
18-232
1989
chi
出版文献量(篇)
7562
总下载数(次)
1
总被引数(次)
31344
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