基于元胞自动机图的2019-nCoV溯源研究

• 作者: 肖绚 薛广富 许召春
• 来源期刊: 计算生物学
• 学科: 工学
• 关键词: 元胞自动机 基因序列可视化 2019-nCov CANNY边缘检测 结构相似性
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 页码范围: 31-40
• 页数: 10页
• 分类号: TP3

摘要

病毒溯源是研究病毒人际传播规律和演化历史,发现病毒的传播机理,并寻找病毒源头是控制疫情的核心科研攻关环节。本文采用元胞自动机将病毒的基因组数据转换为图像,使用Canny边缘检测方法生成特征图像,采用SSIM值评估病毒序列特征图像的相似性,基于病毒序列图像相似性的聚类热图和A-T含量曲线,发现蝙蝠冠状病毒RaTG13和穿山甲冠状病毒在各个指标中都与2019-nCoV更为接近,进而推测出2019-nCoV可能来自蝙蝠,穿山甲可能是该病毒的中间宿主。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖绚	景德镇陶瓷大学生物大数据实验室	78	272	8.0	12.0
2	许召春	景德镇陶瓷大学生物大数据实验室	14	23	3.0	4.0
3	薛广富	景德镇陶瓷大学生物大数据实验室	2	0	0.0	0.0